La Subgerencia de Protección Fronteriza del ICA apoya la formulación, preparación y desarrollo de políticas, planes, programas y proyectos relacionados con los servicios que se prestan en puertos, aeropuertos y pasos de frontera. Además, facilita el comercio internacional de productos agropecuarios mediante la certificación sanitaria y fitosanitaria, la emisión de conceptos técnicos y el control de importaciones y exportaciones de animales, vegetales y productos de origen animal y vegetal.