La principal especie pesquera del departamento es el atún con una producción anual de 31.242 toneladas anuales.
Existen 782 pescadores carnetizados y capacitados por el ICA. Se adelanta un proceso de ordenación pesquera en el Embalse del Guájaro. En cuanto a la producción acuícola las principales especies son camarón, mojarra roja, bocachico alevinos, cachama alevinos, bocachico larvas, cachama larvas.
El Instituto Colombiano Agropecuario, Ica, inicióel repoblamiento del embalse del Guájaro, ubicado en el sur del departamento de Atlántico, con el fin de conservar las pesquerías artesanales presentes en este embalse y mantener la seguridad alimentaria de los municipios y corregimientos aledaños.