Ejecuta acciones de vigilancia fitosanitaria directamente o a través de sensores externos sobre plagas de importancia económica y cuarentenaria en Colombia, para determinar su distribución e incidencia sobre las principales especies vegetales.
Mantiene un sistema de información sobre la condición fitosanitaria del país y difunde la información, de ser procedente, de manera que el Instituto pueda emitir oportunamente medidas y procedimientos para conservar o mejorar el estatus sanitario.
Ejecuta el Plan Nacional de Moscas de la fruta - PNMF, el cual tiene como objetivo la detección, control y erradicación de moscas de la fruta para mejorar las condiciones fitosanitarias de la producción frutícola en Colombia y potenciar la capacidad de esta producción con destino a mercados especializados.
Otras acciones relevantes:
Registro y seguimiento fitosanitario de predios productores de frutas, aromáticas y hortalizas para exportación y sus empresas exportadoras.
Acciones de inspección, vigilancia y control en viveros productores - distribuidores de material de propagación de frutales.